Как обжаловать неправомерное административное расследование?

Здравствуйте. Моя компания стала объектом административного расследования, которое, по моему мнению, проведено с нарушением законодательства. Были допущены ошибки в сборе доказательств и принятии решений. Как можно оспорить результаты расследования и восстановить свою репутацию? Какие документы для этого подготовить и куда обращаться?