Почему не сохраняются изменения в конфигурационном файле?

Здравствуйте. Я вношу изменения в конфигурационный файл, но они не сохраняются после перезагрузки сервера. Я проверил права доступа и синтаксис файла, но проблема сохраняется. Как можно решить проблему с сохранением изменений в конфигурационных файлах?